江苏海洋大学开设了多个研究生专业，主要包括海洋生物学、水产养殖学、海洋环境科学与工程、工程力学、水声工程、水产资源学、水产养殖学、渔业资源与渔业管理、农业机械化及农业电气化、水利工程、生物医学工程、海洋渔业经济学等。这些专业涵盖了海洋科学、水产养殖、环境工程、工程力学、渔业管理等领域，培养了大量的高素质研究生，为我国海洋科技事业的发展做出了重要贡献。
